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Pesawat rapide: "ruse d'Omicron "

Nombre Parcourir:0     auteur:Éditeur du site     publier Temps: 2022-07-22      origine:Propulsé

Pesawat rapide: "ruse d'Omicron "

Pesawat rapide: Omicron's "ruse "

La souche mutante omicron du nouveau coronavirus a des sites de mutation spécifiques qui lui permettent de se cacher du système immunitaire, ce qui le rend très contagieux. Cependant, il existe d'autres loci mutants qui rendent plus difficile de résister à la réponse immunitaire naturelle du corps.

1. Les agents pathogènes de propagation les plus rapides

La souche mutante omicron du nouveau coronavirus peut être le pathogène de propagation le plus rapide de tous les temps. Le virus de la rougeole est le principal pathogène infectieux, et une personne infectée par le virus de la rougeole peut infecter 15 personnes en 12 jours. Mais lorsque la souche mutante de l'omicron est soudainement apparue l'hiver dernier, elle s'est propagée à travers la population si rapidement qu'un cas pourrait devenir six cas après quatre jours, 36 cas après huit jours, et atteindre 216 cas après 12 jours. Fin février de cette année, presque toutes les nouvelles infections au coronavirus aux États-Unis ont été causées par la souche mutante omicron. Lorsque la souche mutante alpha est apparue pour la première fois en novembre 2020, les scientifiques savaient peu de choses sur la façon dont les plusieurs loci mutants qu'il transportaient ont affecté son comportement. Mais maintenant, après plus d'un an de recherche et d'accumulation de données, ils ont pu déchiffrer le mécanisme sous-jacent aux plus de 50 loci mutants sur la souche mutante omicron qui lui permet de se propager rapidement et efficacement. Un tel processus d'enquête prend généralement beaucoup de temps, mais depuis un an, nous étudions ces nouvelles souches mutantes de coronavirus, nous avons donc été bien préparés, ", a déclaré Sriram Subramaniam, biochimiste à l'Université de la Colombie-Britannique au Canada.

La variante omicron a deux fois plus de sites mutants que d'autres souches d'intérêt, et la variante de sa branche de sous-type BA.2 peut avoir encore plus de sites mutants. La souche mutante omicron a 26 à 32 sites mutants sur la protéine de la colonne vertébrale, ce qui est rare parmi d'autres nouveaux mutants de coronavirus. Ces changements structurels lui donnent de nouvelles capacités incroyables. Si la variante delta est le "Hulk " qui s'appuie sur la force brute pour attaquer le corps humain, la variante omicron ressemble davantage au "Flash " - capable d'échapper au système immunitaire et de se propager rapidement.

2. Virus mutants et camouflageTest du NHS et trace Coût de test rapide de l'antigène - UDXBIO

Nous examinerons les quatre changements structurels de la souche mutante omicron à tour à tour. Les trois premiers changements structurels aident le virus à échapper au système immunitaire du corps et à devenir plus infectieux, tandis que le quatrième changement peut permettre à la souche mutante de provoquer des symptômes moins graves.

La souche mutante omicron se camoufle elle-même. La plupart des études ont montré que la vitesse de transmission de la variante omicron est due à un mécanisme biologique unique et efficace: de toutes les nouvelles variantes de coronavirus, la variante omicron est sans égal dans sa capacité à échapper au système immunitaire.

3. Protéines piquantes radicalement modifiées

Dans une analyse publiée dans Science, McCallum et David Veesler, directeur du laboratoire, et d'autres ont montré les résultats du changement dramatique dans la variante omicron: des huit anticorps cliniquement disponibles vers le nouveau coronavirus conçu sur la base d'anticorps naturels, uniquement On se lie toujours efficacement au RBD de la variante omicron. D'autres études ont montré que la capacité du virus à échapper aux anticorps humains acquis par vaccination ou infection est due à des mutations dans le RBD et dans le domaine structurel N-terminal de la protéine Stinger. Parce que la souche mutante omicron a une capacité de camouflage aussi puissante, elle peut se propager à la vitesse de la foudre et ralentit à peine. La bonne chose est que la vaccination, en particulier les boosters du vaccin, peut encore prévenir de graves symptômes.

Lorsque la souche mutante omicron échappe au système immunitaire du corps en modifiant considérablement la protéine Stinger, certains des résidus chimiques de sa protéine Stinger, sur lesquels le virus s'appuie pour entrer dans les cellules, sont ainsi perdus, mais d'autres mutations compensent cette carence. Selon une autre étude publiée dans la revue Science, RBD se lie efficacement au récepteur de la surface cellulaire ACE2 de manière chimique. "Il a apparemment perdu des résidus très importants de liaison aux récepteurs, mais il a compensé à travers d'autres interactions", a déclaré Subramaniam, auteur correspondant du journal.

La protéine Stinger de la souche mutante omicron est également devenue structurellement plus forte. Les deux sous-unités S1 et S2 sur la protéine Stinger d'autres souches mutantes sont plus vaguement connectées. Cela permet également aux protéines piquantes de se séparer et de résumer rapidement dans les cellules humaines lorsque le virus les rencontre. Cependant, cette combinaison délicate présente un inconvénient: de nombreuses épines du nouveau coronavirus se divisent prématurément avant de se rapprocher de la cellule. Une fois divisées ouvertes, ces protéines d'épines sont incapables d'aider le virus à se fixer à la cellule.

Selon plusieurs études, les acides aminés dans certains sites mutés sur les épines de la déformation mutante omicron forment des ponts moléculaires allongés qui permettent aux sous-unités de mieux se lier ensemble. L'une des études pertinentes a été publiée dans le Journal of Medical Virology, laissant plusieurs études publiées dans une plate-forme de préparation qui n'a pas encore été évaluée par des pairs. "Ce virus évite la séparation prématurée des sous-unités de la protéine spinosomale, ", a déclaré Shan-Lu Liu, directeur du programme Virus and Emerging pathogènes à l'Ohio State University, qui est l'auteur de l'un des articles, "lorsque le virus est au bon endroit au bon moment. Sa protéine de couture se sépare et entre dans la cellule, ce qui est différent de la nouvelle souche mutante de la couronne précédente. "

4. Un virus qui peut contourner

La variante omicron utilise également d'autres moyens pour se glisser dans les cellules. Les nouvelles variantes de coronavirus précédentes avaient toutes une caractéristique: le virus s'est appuyé sur TMPRSS2, une protéine à la surface des cellules humaines, pour l'aider à traverser la membrane cellulaire. La variante omicron, cependant, ne nécessite pas TMPRSS2 et entre dans la cellule d'une manière complètement différente: au lieu de pénétrer par la porte d'entrée, il se glisse dans la cellule par la porte latérale.

D'autres souches mutantes nécessitent des protéines ACE2 et TMPRSS2 afin d'injecter le génome dans la cellule. Mais la souche mutante omicron ne se liera qu'au récepteur ACE2 à la surface de la cellule, puis la cellule pénètrera par cytocytose, la résumant dans une bulle creuse appelée endonucléosome et entrant dans la cellule, à quel point la souche mutante omicron éclate en action et commence à prendre le contrôle de toute la cellule.

Les scientifiques spéculent que la souche mutante omicron peut avoir obtenu deux avantages de cette manière. Premièrement, de nombreuses cellules du corps n'ont pas la protéine TMPRSS2 à leur surface, donc si le virus n'a pas besoin de cette protéine de surface pour envahir les cellules, elle peut infecter une classe de cellules beaucoup plus large. "Une spéculation actuelle est que si le virus pénètre dans les cellules par l'endosome nucléaire plutôt que de s'appuyer sur la protéine TMPRSS2, il serait en mesure d'infecter sept fois, voire 10 fois, plus de cellules que d'autres souches mutantes, ", a déclaré Wendy Barclay , virologue à l'Imperial College de Londres, Royaume-Uni. Wendy Barclay, virologue à l'Imperial College de Londres. Son équipe, avec d'autres scientifiques, a découvert une nouvelle façon pour la variante omicron d'invahir les cellules et a publié un article de préparation.

En plus de cela, la variante delta se faufile souvent profondément dans les voies respiratoires et infecte les cellules pulmonaires riches en protéine TMPRSS2, mais la variante omicron est capable de se répliquer rapidement juste au-dessus des poumons des voies respiratoires, ce qui peut l'aider à se propager dans la population . Joe Grove, virologue à l'Université de Glasgow au Royaume-Uni et co-auteur de l'article préimprimét Éternuements pour faciliter la propagation du virus. "

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5. Mutations qui ne doivent pas être prises à la légère

Contrairement aux trois premiers changements, le quatrième et dernier changement dans la souche mutante omicron ne le rend pas plus contagieux. Au lieu de cela, le changement lui donne une faiblesse surprenante: une plus grande vulnérabilité à attaquer par le système immunitaire inné dans notre corps. Les scientifiques ont testé les variantes omicron et delta pour leur réponse à l'interféron. Les interférons sont une classe de protéines qui agissent comme des signaux routiers, envoyant des alertes envahisses aux cellules immunitaires innées. La souche mutante delta excelle à supprimer la réponse de l'interféron, cependant, la souche mutante omicron est si mauvaise pour le supprimer qu'elle active réellement la signalisation de l'interféron dans le corps.

Pour le moment, les chercheurs ne comprennent pas comment cette altération se produit. Au moins 11 des 26 protéines du coronavirus peuvent interagir avec l'interféron dans le corps, mais beaucoup d'entre elles sont mutées dans la variante omicron. Bien que le mécanisme exact impliqué ne soit pas connu, les scientifiques peuvent également voir largement les conséquences impliquées par de tels changements.

La réponse de l'interféron serait plus prononcée dans les poumons que dans les voies respiratoires supérieures, de sorte que la vulnérabilité de la variante omicron dans la suppression de la réponse de l'interféron pourrait l'empêcher de se propager à des organes plus profonds. Martin Michaelis, biologiste de l'Université de Kent en Angleterre, a déclaré: "Cela donne une signification biologique pour le phénomène que nous voyons. " Dans un article publié dans la revue Cell Research, il a analysé comment la souche mutante omicron interagit avec l'interféron . Il a également dit: "Il semble peu probable que la souche mutante omicron ille plus loin dans le corps, comme les poumons, et provoquerait une maladie grave. "

Mais le fait est que la variante omicron n'a pas d'effet léger sur les humains dans son ensemble, et cela provoque une augmentation spectaculaire des hospitalisations et des décès, avec des taux records d'enfants hospitalisés. Cependant, chez certains individus infectés et des modèles animaux, cette variante ne semble pas provoquer une maladie grave. Cependant, le risque de maladie grave et de décès reste élevé pour les personnes qui ne sont pas vaccinées ou qui ont d'autres facteurs de risque.

Si de nouvelles souches mutantes émergeront à l'avenir, il peut y avoir d'autres changements dans la structure biologique des souches mutantes et leur capacité à être infectée en conséquence. "Je suis sûr que nous ne pouvons pas nous reposer sur nos lauriers et dire que tout est fini", a déclaré Buckley. Alors que le nouveau coronavirus continue de se propager et d'évoluer dans le monde, le virus se propagera de manière plus diversifiée, y compris même certains auxquels les scientifiques n'ont pas encore pensé.