Nomenclature SARS-COV-2

Variants SARS-COV-2 sont regroupés en fonction de leurs lignées et de leurs mutations composantes. De nombreuses organisations, y compris les gouvernements et les médias, se réfèrent familièrement à des variantes pertinentes dans le pays où ils ont été découverts. Après des mois de discussions, le 31 mai 2021, l'Organisation mondiale de la santé a annoncé que la grec Les noms de lettres pour les souches importantes, les mentionnez facilement de manière stigmatisée. Cette décision peut avoir été en partie motivée par la critique du gouvernement de l'utilisation des noms de pays pour désigner les variantes virales; L'Organisation mondiale de la santé a mentionné que la mention des noms de pays pourrait créer une stigmatisation. Après avoir en utilisant toutes les lettres d'Alpha à Mu, qui en novembre 2021 a sauté les deux lettres suivantes de l'alphabet grec, Nu et Xi, et a utilisé Omicron, qui l'a déclenché a été spéculé sur que Xi a été sauté pour éviter l'offensive le leader chinois Xi Jinping. L'explication donnée par l'OMS est que Nu est trop facilement confondue avec "xin " et Xi est un nom de famille commun.Si qui utilise tout l'alphabet grec, l'agence considère que la nom Variantes futures après les constellations.

Lignées et clades

Bien qu'il existe des milliers de variantes de SARS-CoV-2, les sous-types du virus peuvent être divisés en groupes plus grands, tels que les lignées ou les clades. Trois principales, couramment utilisées, ont été proposées:

• En janvier 2021, Gisaid faisant référence à SARS-COV-2 alors que HCOV-19 a identifié huit clades mondiaux (S, O, L, V, G, GH, GR et GV).

• 2017, Hadfield et al. Annonçant NextStrain, qui vise à suivre l'évolution des pathogènes en temps réel. "NextStrain a ensuite été utilisé pour suivre le SARS-COV-2, identifiant 13 clades majeurs [D] (19A - B, 20A - 20J et 21A) à partir de Juin 2021.

• Affectation phylogénétique des lignées d'épidémie globale nommées (pangolin). "Une nomenclature dynamique pour les lignées SARS-COV-2, en se concentrant sur les lignées virales et les lignées virales circulantes activement "; en août 2021, 1340 lignées ont été attribuées.Chaque agence nationale de santé publique pourrait également créer sa propre nomenclature pour suivre les variantes spécifiques. Par exemple, la santé publique de l'Angleterre désigne chaque variante suivie par année, mois et numéro dans le format [Yyyy] [mm] / [nn], préfixant soit le Variante sous enquête ou la variante d'intérêt avec "Vui " ou "voc ". Le système a été modifié et utilise désormais le format [Yy] [MMM] - [nn] où le mois est écrit en utilisant un trois- code de lettre.

Classification des variantes

Les variantes qui semblent répondre à un ou plusieurs critères spécifiques au cours de la pandémie Covid-19 peuvent être signalées comme des «variantes d'intérêt» ou des «variantes sous enquête» («VUI»), en attendant une enquête plus approfondie de ces attributs. Vérifier et confirmer. Une fois validé, la variante / VUI d'intérêt peut être renommée comme une "variante de préoccupation " par une organisation de surveillance, comme le CDC aux États-Unis. Une catégorie connexe est "des variantes de conséquences élevées, " que le CDC Utilisations en cas de preuve claire que la prévention ou les interventions ciblant une variante particulière sont sensiblement moins efficaces.

Standard de popularité

Les virus mutent souvent au fil du temps, créant de nouvelles variantes. Seuls quelques nucléotides.

Certaines conséquences potentielles des variantes émergentes sont les suivantes:

• Améliorer la capacité de diffusion

• Morbidité accrue

• Accrue de la mortalité

• Capacité à échapper à la détection par des tests de diagnostic

• Diminution de la sensibilité aux médicaments antiviraux (si de tels médicaments sont disponibles)

• Diminution de la sensibilité aux anticorps neutralisants, qu'ils soient thérapeutiques (par exemple, plasma convalescent ou anticorps monoclonaux) ou des tests de laboratoire

• Capacité à échapper à l'immunité naturelle (par exemple, provoquer une réinfection)

• Capacité à infecter les individus vaccinés

• Risque accru de certaines maladies telles que le syndrome inflammatoire multisystème ou la covide à long terme.

Une affinité accrue pour des groupes démographiques ou cliniques spécifiques, tels que les enfants ou les individus immunodéprimés.Les variantes qui semblent répondre à un ou plusieurs de ces critères peuvent être signalées comme "Variants sous enquête " ou "variantes d'intérêt ", en attendant la vérification et la confirmation de ces propriétés. La principale caractéristique d'une variante d'intérêt est qu'il est qu'il montre la preuve que c'est la cause d'une proportion accrue de cas ou d'une épidémie unique; Cependant, il doit également avoir une prévalence ou une expansion limitée au niveau du pays, sinon la classification sera élevée à une «variante de préoccupation». Body ". Une variante est appelée une variante de conséquences " à haute teneur en matière de conséquences s'il existe des preuves claires que les mesures de prévention ou d'intervention ciblant une variante spécifique sont sensiblement moins efficaces.