Variantes de SARS-COV-2

Il existe de nombreuses variantes de syndrome respiratoire aiguë sévère Coronavirus 2 (SARS-COV-2), le virus qui cause la maladie du coronavirus 2019 (Covid-19). Certains sont pris en compte ou ont été déclarés d'une importance particulière car ils peuvent augmenter la transmissibilité d'augmenter la virulence ou réduire l'efficacité des vaccins dirigés contre eux. La pandémie covide-19.En mai 2023, seuls Omicron et sa propre variante [indiscernables] ont été désignés par l'Organisation mondiale de la santé comme des variantes de préoccupation circulantes.

Aperçu

L'origine du SARS-COV-2 n'a pas été déterminée. Hombalement, l'émergence de SARS-COV-2 peut être le résultat d'un événement de recombinaison entre les COV de type SRAS et les COV de pangolin via la transmission entre espèces. du virus SARS-COV-2 a été collecté chez les patients en décembre 2019, et les chercheurs chinois ont comparé ces premiers génomes avec des souches de coronavirus BAT et pangolin pour estimer le type de coronavirus humain ancestral; Le type de génome ancestral déterminé est marqué "s " et son type dérivé dominant est marqué "l " pour refléter le changement d'acide aminé mutant. Indépendamment, les chercheurs occidentaux ont effectué une analyse similaire mais ont étiqueté le type ancestral comme "a " et le type dérivé comme "b ". Type B dans d'autres types, y compris B.1, l'ancêtre de la variante du global majeur Concern, étiqueté par l'Organisation mondiale de la santé comme des variantes alpha, bêta, gamma, delta et omicron en 2021.Dans les premiers stades d'une pandémie, le nombre relativement faible d'infections (par rapport aux étapes ultérieures de la pandémie) conduit à moins de possibilités de mutations dans le génome viral et donc à moins de chances de variation divergente. , il est également rare d'observer des mutations de la protéine S dans la région du domaine de liaison aux récepteurs (RBD) qui interagit avec ACE2.

Au fil du temps, l'évolution du génome SARS-COV-2 (via des mutations aléatoires) a entraîné des échantillons mutés du virus (c'est-à-dire une variation génétique) qui ont été observés comme plus transmissibles, étant naturellement sélectionnés. ont été observés comme plus transmissibles que les souches précédemment identifiées.Certaines variantes SARS-COV-2 sont considérées comme inquiétantes car elles maintiennent (ou même augmentent) leur forme physique réplicative face à une immunité croissante de la population, soit par la récupération de l'infection, soit par les vaccins inoculés. .Le tableau ci-dessous présente des informations et des niveaux de risque relatifs pour les variantes de préoccupation actuelles et précédemment répandues (COV). Autrement indiqué, ces intervalles supposent une confiance ou un niveau de confiance. sont approximatifs. Il n'y a eu aucun changement dans la précision des tests pour l'alpha, la bêta, le gamma et le delta, certains mAb ont conservé l'activité des anticorps neutralisants. Les tests PCR continuent de détecter les variantes omicron.